Comparative  GENOME  Analyses  

Table 2.4.1:  Assignment and alignments of Linkage Groups in different Maps based on Anchor markers

updated 15/7/03 

M-Type:

M-Name

LAGT07

MYD20

 

 

 

 

Com M

26/3

III

L3

Com M

40/5

IV

L7

Com M

24/2

V

L11

Com M

35/2

V

L11

Com M

22/5

VII

L12

Com M

23/2

VIII

L4

Com M

60/4

VIII

L4

Com M

23/3

XI

L2

Com M

17/4

XIII

L6

Com M

90/1

XIII

L6

Com M

28/4

XIII

L6

Com M

34/2

XIV

L14

Com M

108/4

XV

L1

 

 

M-Type:

M-Name

EAT1011

RLT0710

 

 

 

 

Com M

 

L1

 

Com M

91/4

L2

12

Com M

130/5

L3

7

Com M

17/8

L4

11

Com M

116/8

L5

6

Com M

136/8

L6

1

Com M

132/8

L7

3

Com M

5/2

L8

9

Com M

46/3

L9

13

Com M

 

L10

 

Com M

88/4

95/5

L11

4

SSR

mCnCIR2

mnCnCIR57

61/4

L12

10

Com M

97/10

135/4

131/10

L13

2

Com M

87/2

60/8

101/2

L14

14

Com M

 

L15

 

Com M

128/6

L16

8

 

Table 2.4.2: Association of Linkage groups based on SSR markers

 

MAP:

LAGT

07

MYD

20

 

EAT

0707

 

 

 

 

EAT

1011

 

 

 

No

NPF

NAME

LG

LG

 

No

NPF

NAME

LG

 

No

NPF

NAME

LG

104

3

CNZ01

VIII

L4

 

90

1

CNZ01

G16

 

 

 

 

--

105

2

CNZ02

VII

np

 

91

1

CNZ02

G9

 

 

 

 

--

 

 

 

np

np

 

106

1

CNZ03

G2

 

1

1

CNZ03

5

106

1

CNZ05

IX

np

 

 

 

 

np

 

2

1

CNZ05

15

123

1

CNZ09

unm

np

 

107

1

CNZ09

G12

 

3

1

CNZ09

1

125

1

CNZ12

XIII

np

 

108

1

CNZ12

G2

 

4

1

CNZ12

unm

127

1

CNZ18

III

np

 

109

1

CNZ18

G10

 

 

 

 

--

 

 

 

np

np

 

110

1

CNZ23

G6

 

5

1

CNZ23

13

130

1

CNZ24

XII

np

 

 

 

 

np

 

6

1

CNZ24

13

131

2

CNZ29

V

np

 

111

1

CNZ29

G1

 

8

1

CNZ29

2

 

 

 

np

np

 

97

2

CNZ42

G5

 

11

1

CNZ42

10

107

2

CNZ43

VI

L10

 

98

1

CNZ43

G2

 

 

 

 

--

133

1

CAC10

IV

np

 

103

2

CAC10

G13

 

 

 

 

--

132

1

CAC8

IV

np

 

102

1

CAC8

G9

 

 

 

 

--

122

2

CAC2

II

np

 

99

1

CAC2

G11

 

 

 

 

--

 

 

 

np

np

 

93

2

CNIC6

G1

 

13

1

CNIC6

2

 

 

 

np

np

 

89

2

CN11E10

G1

 

12

1

CN11E10

2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

103

4

CNZ04

XII

L15

 

92

1

CNZ06

G8

 

7

1

CNZ26

10

124

2

CNZ10

II

np

 

112

1

CNZ31

G15

 

9

1

CNZ33

2

126

1

CNZ16

XII

np

 

113

2

CNZ44

ua(5)

 

10

1

CNZ40

10

128

1

CNZ19

np

L9

 

114

2

CNZ46

G9

 

14

1

CnCirA4

12

129

2

CNZ21

IX

np

 

104

1

CAC11

G2

 

16

1

CnCirB11

10

 

 

 

 

 

 

105

1

CAC13

G2

 

17

1

CnCirB12

8

 

 

 

 

 

 

100

1

CAC3

G9

 

15

1

CnCirB3

3

 

 

 

 

 

 

101

1

CAC4

G5

 

20

1

CnCirC11

11

 

 

 

 

 

 

94

2

CN1H2

G5

 

18

1

CnCirC5

4

 

 

 

 

 

 

95

2

CN2A5

G7

 

19

1

CnCirC9

4

 

 

 

 

 

 

96

2

CNIG4

G8

 

21

1

CnCirD1

4

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

22

1

CnCirD8

8

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

23

1

CnCirE1

4

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

24

1

CnCirF3

4

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Tot:

17

28 Frag.

 

 

 

Tot:

26

35 Frag.

 

 

Tot:

24

24 Frag.

 

 

Table 2.4.3: Association of linkage groups in different maps

 

 

 

 

LAGT07

MYD20

EAT0707

EAT1011

I

 

 

 

II

 

G11

 

III

L3

G10

 

IV

L7

G13